تبارزایی مولکولی ژنگان A در برخی از گونه های Triticum L. با استفاده از توالی های بین رونوشتهای ریبوزومی (ITS)
نویسندگان
چکیده مقاله:
درگیاهان خانوادۀ غلات (Poaceae) جنسTriticum L. شامل گندم نان و دیگر گونههای مهم زراعی است که اهمیت اقتصادی بسیار بالایی در تغذیۀ انسان دارند. در این پژوهش، تبارزایی مولکولی گونههای جنس Triticum L. دارای ژنگان (ژنوم) A (T. aestivum، T. turgidum، T. urartu و T. boeticum) بررسی شد. برای این منظور توالیهای بین رونوشتهای ریبوزومی (ITS) با استفاده از دو جفت آغازگر اختصاصی از روی DNAی ژنگانی استخراج‌شده از 26 ژنوتیپ از گونههای بالا، افزایش و توالییابی شد. توالیها با استفاده از نرمافزار MEGA 5.0 و با الگوریتم ClustalW هم‌ردیف شدند. ماتریس فاصلهها محاسبه و درختوارۀ ژنی ترسیم شد. نتایج نشان داد، طول توالیهای ITS1 و ITS2 به ترتیب 650 جفت باز و 700 جفت باز و محتوای G+C به ترتیب 25/60 و 50/60 بود. حفاظت‌شدگی بالایی در نواحی ITS جمعیتها مشاهده شد (63 و 88 درصد، به ترتیب). تحلیل تبارزایی (فیلوژنتیکی) انجام‌شده با استفاده از توالیهای افزایش شده، به‌خوبی گندمهای دیپلوئید و پلیپلوئید را در دو گروه جداگانه قرار داد. نتایج نشان داد، رابطه‌های نزدیکی بین T. aestivum و T. turgidum و همچنین بین T.urartu و T.boeticum وجود دارد. به‌طورکلی، این بررسی نشان داد، نشانگرهای مولکولی ITS برای بررسی‌های تبارزایی بسیار مناسب هستند.
منابع مشابه
مطالعه گونه های یونجه (medicago l.) براساس توالی یابی dna ریبوزومی هسته ناحیه its
بررسی روابط تکاملی و فیلوژنی در گیاهان، از طریق صفات مورفولوژیکی همواره متداول بوده است. گیاهان براساس ویژگی های موفولوژیک متمایزکننده شناسایی می شوند (du1 et al., 2006). در بعضی موارد شناسایی گونه های گیاهی براساس صفات موفولوژیک مشکل و دارای محدودیت است. در مواردی نشانگرها و صفات مورفولوژیک به علت تاثیرپذیری از محیط کارایی کمی در شناسایی و رده بندی گونه ها دارند (shen et al., 1998). در سال ها...
15 صفحه اولبررسی فیلوژنتیکی گونه های a. raphani ،alternaria arborescens، a. brassisicola و a. alternata با استفاده از توالی its
جنس alternaria یکی از فراوان ترین جنس های قارچی است که در مکان های متنوعی در سراسر دنیا یافت می شود و شامل گونه های بیماری زای گیاهی و پوده زی است که باعث وارد شدن خسارت به بسیاری از گیاهان و یا موجب فساد محصولات کشاورزی پس از برداشت می گردند. میزان خسارت در گونه های بیماریزای گیاهی متغیر است. تعدادی از گونه های این جنس بیماریزای گیاهان بوده و بیماریهای مهم و اقتصادی را در تعدادی ازگیاهان ایجاد...
15 صفحه اولشناسایی مولکولی cochliobolus sativusعامل بیماری لکه سوختگی گندم با استفاده از توالی یابی its ریبوزومی و بررسی روابط فیلوژنتیکی گونه های موجود در جنس cochliobolus
عامل بیماری لکه سوختگی گندم قارچcochliobolus sativus است که در بسیاری از مناطق جهان به عنوان یکی از مهم ترین بیماری های گندم مطرح است. از مناطق آلوده شمال کشور نمونه های مشکوک به این بیماری جمع آوری و از میان آن ها هشت جدایه عامل بیماری به عنوان نماینده انتخاب و مورد بررسی مورفولوژیکی، اثبات بیماریزایی و مولکولی قرار گرفتند. مشخصات مورفولوژیکی جدایه ها با استفاده از کلیدهای معتبر نشان داد که عل...
متن کاملشناسایی برخی گونه های کاردامینه در ایران با استفاده از نشانگر ملکولی ITS
جنسCardamine L. از خانواده Brassicaceaeبا بیش از 200 گونه در جهان و 7 گونه در ایران با توجه به تنوع کاریولوژی و مورفولوژی بالا، گیاه مناسبی برای بررسی های فیلوژنتیکی و تکامل می باشد. گونه کاردامینه هیرسوتا از این جنس بتازگی بعنوان گیاهی مدل در مطالعات مقایسه ای تکاملی معرفی شده است. این گیاه از هفت منطقه مختلف ایران جمع آوری و پس از استخراج DNA ی برگی، ناحیه ITS آنها با استفاده از پرایمر های IT...
متن کاملارزیابی تنوع ژنتیکی صفات مورفولوژیک برخی از ژنوتیپ های گندم (Triticum aestivum L.) با استفاده از روش های چند متغیره
Appropriate selection of donor parent for breeding purposes needs sufficient knowledge about genetic diversity and germplasm classification. In order to investigation and classification of genetic diversity in 35 wheat (Triticum aestivum L.) genotypes, an experiment was conducted in University of Shahed based on randomized complete block design with 2 replications in 2009. In persent study 15 m...
متن کاملارزیابی مولکولی رابطه فیلوژنتیک جمعیت‌هایی از لاله واژگون ایران با استفاده از توالی ناحیه ITS
جنس لاله واژگون (Fritillaria) دربردارنده بیش از 140 گونه در خانواده سوسنیان میباشد که از میان آنها گونه F. imperialis از نظر زینتی و دارویی از ارزش و اهمیت بالایی برخوردار است. تعداد 19 جمعیت از لاله واژگون از رویشگاههای طبیعی خود واقع در 6 استان کشور جمعآوری شدند. ارزیابیهای فیلوژنتیک بر اساس توالی ناحیه ITS در سطح DNA هستهای و با استفاده از روش‌های «نیبرجوینینگ» و «ماکسیمم لایکلیهود»...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 48 شماره 2
صفحات 483- 491
تاریخ انتشار 2017-08-23
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023